把最近学到的工具整理一下：grep, cut, paste, join。
更厉害的sed, awk, regex还是单开文章来写吧。
### cut
`cut`的作用是从文件中按列取内容。
参数：
```
-f 按field取列。
-d 分隔符，用于指示文件以什么分列，默认为tab。与-f配合使用。
-c 按字符数取列。
```
示例：（就用手边的一个bed文件做例子）
```
# 原始文件内容
head text.bed
chr1 2090 2475
chr1 2584 3083
chr1 4692 4832
chr1 4692 5658
chr1 4901 5658
chr1 5805 6469
chr1 5810 6469
chr1 6628 6716
chr1 6628 6720
chr1 6628 6738
#某些字符的列
cut -c 1-2,6-9 text.bed | head
ch090
ch584
ch692
ch692
ch901
ch805
ch810
ch628
ch628
ch628
# 第2列内容
cut -f2 text.bed | head
2090
2584
4692
4692
4901
5805
5810
6628
6628
6628
```
### `paste`
paste顾名思义就是把内容“粘贴”起来。
### `join`
### `grep`
grep 是一个非常常用的，查询／匹配用的命令。
基本用法：
``` bash
grep apple test.txt
```
参数含义：
``` bash
$ man grep
grep [-abcdDEFGHhIiJLlmnOopqRSsUVvwxZ] [-A num] [-B num] [-C[num]]
[-e pattern] [-f file] [--binary-files=value] [--color[=when]]
[--colour[=when]] [--context[=num]] [--label] [--line-buffered]
[--null] [pattern] [file ...]
```
小技巧：
``` bash
# match tab in grep 匹配制表符
grep apple$'t' test.txt
# logic and in grep 逻辑与
# logic or in grep 逻辑或
```
未完待续...